飞行时间质谱联用仪具有高分辨、高灵敏度和高采集速度的优异功能，实现了与全二维气相色谱、快速气相色谱的对接。
 

　　飞行时间质谱联用仪的主要功能：
 

　　蛋白质组研究中蛋白质/多肽的表征、蛋白质翻译后修饰的检测，基因组学中核酸的分析，以及多糖、高分子化合物的分析。常用于分析较简单的肽段混合物，如二维凝胶电泳蛋白质点或单一SDS-PAGE分离蛋白质的酶切提取肽混合物，进而获得肽质量指纹谱(PMF)信息，是目前蛋白质组研究中较常用的胶上蛋白质鉴定技术。TOF/TOF中采用激光诱导解离(LID)和高能碰撞诱导解离(CID)获取结构信息。
 

　　飞行时间质谱联用仪的性能特点：
 

　　电子轰击离子源：具有高电离效率和引出效率的电子轰击源，配合优化设计的垂直引入式飞行时间分析器，使其获得了全扫描灵敏度达到了四极杆质谱选择离子扫描的灵敏度(1pg OFN的S/N>500:1，0.1pg OFN的S/N>50:1)，痕量分析要求
 

　　质量分析器：采用离子正交引入式和二级反射镜设计的飞行时间分析器，大大减小了离子初始能量分散，不仅保证了具有比四极杆气质联用仪更高的分辨率和更宽的质量范围(1~1200amu)，且质量精度高，长期稳定性小于0.01amu，从而实现了对特征离子的精确窗口提取，较大地改善谱图的信噪比
 

　　信号采集记录系统：采用带有硬件累加功能的高速模数转换记录器(1GHz/2GHz SPS)。因此，在获得更宽线性范围的同时，更能记录质谱峰，提高定量分析的准确性
 

　　真空系统：采用双涡轮分子泵+双全量程复合数字真空规设计，可以实时监测真空；离子源区的分子泵抽速高达350L/s,不仅满足大流速要求，而且能大大降低样品污染和背景干扰
 

　　电气控制系统：完善、可靠的真空监控与电气保护系统